Narodowe Centrum Nauki (NCN) przyznało dofinansowanie dla dwóch nowych projektów IPPT PAN:
- „Nieswoista odpowiedź immunologiczna na infekcję wirusową RSV, rola wirusowych białek niestrukturalnych. Analiza doświadczalna i modelowanie sygnalizacji wewnątrz- i międzykomórkowej” (HARMONIA 6).
Kierownikiem Projektu jest prof. dr hab. Tomasz Lipniacki.
W zespole badawczym pracować będą: dr Maciej Czerkies, dr Zbigniew Korwek, dr inż. Wiktor Prus, dr Joanna Jaruszewicz-Błońska, mgr Marek Kochańczyk, dr inż. Sławomir Błoński z IPPT PAN oraz dwóch partnerów zagranicznych: prof. Allan Brasier (University of Texas Medical Branch, TX, US), prof. Marek Kimmel (Rice University, TX, US).
Celem projektu jest zbadanie, w jaki sposób wirusy rodziny Paramyxoviridae unikają mechanizmów odporności wrodzonej, i stworzenie funkcjonalnego modelu matematycznego odpowiedzi odpornościowej na infekcję RSV. Przeprowadzimy analizę odpowiedzi komórek nabłonka płuc linii A549 na infekcję paramyksowirusem RSV, zarówno szczepu dzikiego, jak i zrekombinowanego pozbawionego jednego lub obu białek niestrukturalnych NS1 i NS2. Jako punkt odniesienia potraktujemy stymulację analogiem strukturalnym wirusowego RNA, poli(I:C). Białka NS1/2 są uważane za źródło zdolności wirusa do wyciszania odpowiedzi układu odpornościowego poprzez blokowanie (w oparciu o różne mechanizmy) parakrynnej sygnalizacji IFNβ. Nasze badania wykazały, że odpowiedź komórek linii A549 oraz mysich embrionalnych fibroblastów na dsRNA i poli(I:C) jest kontrolowana przez współdziałanie ścieżek sygnałowych czynników transkrypcyjnych IRF3 i NF-κB, przy czym w późniejszej fazie odpowiedzi kluczową rolę odgrywa sygnalizacja parakrynna przez IFNβ (blokada receptora IFN wycisza ekspresję białek niezbędnych do ustabilizowania się stanu antywirusowego). Znaczenie sygnalizacji parakrynnej stanowi motywację do zbadania roli NS1/2 w blokowaniu syntezy IFNβ.
- „Badanie oddziaływań hydrodynamicznych kropel w złożonych strukturach mikroprzepływowych. Opracowanie podstaw algorytmów opartych na architekturze mikrokanałów umożliwiających dozowanie reagentów z dowolną dokładnością” (SONATA BIS 6).
Kierownikiem Projektu jest dr Piotr Korczyk.
Głównym celem projektu jest wyjaśnienie podstawowych mechanizmów odpowiedzialnych za zachowanie mikrokropelek w kapilarach o złożonej geometrii (zwanych pułapkami mikroprzepływowymi) i zbadanie bardziej złożonych systemów składających się z wielu modułów, które pozwolą na wykonanie skomplikowanych sekwencji operacji na stężeniach reagentów w kropelkach. Takie podejście pozwoli na rozwój algorytmów opartych na architekturze mikrokanałów, które umożliwią dozowanie stężenia regentów z dużą precyzją. Badania te pozwolą ustalić eksperymentalne i teoretyczne podstawy, które mogą przysłużyć się do wykonywania złożonych protokołów na małych objętościach próbek biochemicznych, zamkniętych w kropelkach.