1994
Na bazie zamiejscowych Zakładów IPPT w Poznaniu utworzono Oddział Zamiejscowy IPPT PAN w Poznaniu.
Zakład Mechaniki Ośrodków Ciągłych (ZMOC) zmienił nazwę na: Zakład Wytrzymałości Materiałów (ZWM) - kier. Prof. Lech Dietrich
Zakład Teorii Fal Elektromagnetycznych wchodzi w strukturę organizacyjną Ośrodka Mechaniki i przekształca się w Samodzielną Pracownię Teorii Fal Elektromechanicznych (kier. Prof. Eugeniusz Danicki)
Pracownia Metod Ultradźwiękowych w Biologii i Medycynie należąca do Zakładu Ultradźwięków zmienia nazwę na: Pracownia Mikroskopii Akustycznej
1996
Centrum Akustoelektroniki przekształca się Ośrodek Akustoelektroniki
Powołano Zakład Problemów Eko -Budownictwa (prof. Wojciech Dzieniszewski)
Zakład Technologicznych Zastosowań Laserów przekształca się w Samodzielną Pracownię Technologicznych Zastosowań Laserów
Zostają rozwiązane jednostki organizacyjne IPPT w Poznaniu:
- Zakład Mechaniki i Akustyki Ośrodków Porowatych,
- Zakład Fonetyki Akustycznej.
1997
Centrum Mechatroniki przekształca się w Ośrodek Mechatroniki.
Powołano Zakład Mechaniki Cieczy i Gazów w strukturze Ośrodka Mechaniki.
1998
Ośrodek Mechaniki zmienia nazwę na Ośrodek Mechaniki i Informatyki Stosowanej.
Zakład Mechaniki Cieczy i Gazów zmienia nazwę na Zakład Mechaniki i Fizyki Płynów, wchodząc do Ośrodka Mechaniki i Informatyki Stosowanej
Ulega rozwiązaniu Centrum Fizyki i Matematyki Stosowanej.
1999
Powołano w strukturze Ośrodka Mechaniki i Informatyki Stosowanej - Zakład Metod Komputerowych.
W wyniku rozstrzygnięcia konkursu, decyzją Komitetu Badań Naukowych został utworzony w Instytucie Krajowy Punkt Kontaktowy 5-tego Programu Ramowego Badań, Rozwoju Technicznego i Prezentacji Unii Europejskiej (KPK). Na stanowisko Dyrektora KPK został powołany dr inż. Andrzej Siemaszko.
2000
Rozpoczęło działalność Centrum Doskonałości "Nowoczesne Materiały i Konstrukcje" - AMAS The Center of Excellence for Advanced Materials and Structures] - koordynator: prof. Z. Mróz.
Rozpoczęło działalność Centrum Doskonałości "Systemy Ciśnieniowe o Ekstremalnych Warunkach Pracy" [The Center of Excellence for Safety - Critical Pressure Systems]- koordynator: prof. L. Dietrich.
2001Powołano w strukturze Ośrodka Mechaniki i Informatyki Stosowanej - Zakład Mechaniki Materiałów.